Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms