Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms