Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms