Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms