Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTMAP06454 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms