Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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