Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FRMD3A2A2Y4 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms