Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
MAP3K4Q9Y6R4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms