Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAD1L1Q9Y6D9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms