Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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SNX13Q9Y5W8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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SNX13Q9Y5W8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SNX13Q9Y5W8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SNX13Q9Y5W8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SNX13Q9Y5W8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SNX13Q9Y5W8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX13Q9Y5W8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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