Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROG3Q9Y4Z2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEUROG3Q9Y4Z2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms