Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC52.44■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC52.43■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC52.43■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC52.42■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC52.42■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC52.4■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC52.39■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC52.39■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.38■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.38■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
NISCHQ9Y2I1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.36■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC52.36■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC52.36■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC52.34■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC52.34■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC52.32■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC52.32■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.32■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.97
NISCHQ9Y2I1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC52.31■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC52.3■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC52.29■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC52.29■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC52.27■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC52.27■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.96
NISCHQ9Y2I1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC52.25■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC52.23■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC52.23■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC52.23■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC52.22■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.21■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC52.21■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC52.2■■■■■ 5.95
NISCHQ9Y2I1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.2■■■■■ 5.95
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