Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GINS2Q9Y248 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms