Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms