Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN6Q9UQ52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms