Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAPRE3Q9UPY8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAPRE3Q9UPY8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms