Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM35Q9UPQ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM35Q9UPQ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms