Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A4Q9UP95 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A4Q9UP95 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms