Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR3

TBX20, T-box transcription factor TBX20, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX20Q9UMR3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX20Q9UMR3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX20Q9UMR3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms