Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO1Q9UM00 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO1Q9UM00 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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