Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIZ1Q9ULV3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIZ1Q9ULV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms