Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSEQ9UL01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms