Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC23Q9UJX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC23Q9UJX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms