Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUF60Q9UHX1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUF60Q9UHX1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms