Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX25Q9UHL0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms