Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO40Q9UH90 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms