Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SWAP70Q9UH65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SWAP70Q9UH65 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms