Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms