Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEPT3Q9UH03 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms