Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT8Q9UFF9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms