Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA6Q9UF33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms