Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK3Q9UBP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms