Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-18Q9QC07 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms