Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
REREQ9P2R6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms