Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms