Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS18Q9P253 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms