Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT4Q9P109 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms