Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP5Q9NZZ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms