Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKIPSDQ9NZQ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms