Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF38Q9NXL2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms