Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms