Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF19AQ9NV58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms