Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMBRD1Q9NUN5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMBRD1Q9NUN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms