Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI6

BRWD1, Bromodomain and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD1Q9NSI6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRWD1Q9NSI6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRWD1Q9NSI6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRWD1Q9NSI6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD1Q9NSI6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRWD1Q9NSI6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms