Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHST12Q9NRB3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms