Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK2Q9NRA0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK2Q9NRA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms