Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PXMP2Q9NR77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PXMP2Q9NR77 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms