Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS2Q9NR19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSS2Q9NR19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms