Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPHNQ9NQX3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPHNQ9NQX3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms