Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms